Oddelek za podnebno politiko v kmetijstvu spremlja stanje, sodeluje pri pripravi sistemskih rešitev na področju prilagajanja in blaženja podnebnih sprememb v kmetijstvu, vključno s področjem energije v kmetijstvu, rabe vode v kmetijstvu, uvajanju rešitev, temelječih na naravi (ang. »nature based solutions«) ter krepi sinergije z biodiverziteto, ogljičnim kmetovanjem, krožnim gospodarstvom in biogospodarstvom. Aktivni so tudi na področju preobrazbe v trajnostne prehranske sisteme, prehranske varnosti in prehranske suverenosti, na področju uvajanja digitalizacije in robotizacije z vidika podnebnih vsebin, sodeluje pri iskanju sistemskih rešitev na področju obračunavanja emisij toplogrednih plinov, ki nastanejo pri dejavnostih v zvezi z rabo zemljišč, spremembo rabe zemljišč in kmetijske proizvodnje (LULUCF) in druge aktivnosti, ki se navezujejo na področje podnebnih sprememb v kmetijstvu.

Oddelek za sistem znanja in inovacij v kmetijstvu izvaja naloge koordinacijskega telesa za sistem znanja in inovacij v kmetijstvu (AKIS). Poleg tega nudi podporo subjektom inovacijskega podpornega okolja v smislu krepitve raziskovalne infrastrukture in razvoja podpornih inovacijskih storitev, vključno z izvajanjem nalog inovacijskega posredništva v okviru t.i. EIP-VEM točke, vzpostavlja povezave med projekti Obzorje Evropa, ciljnimi raziskovalnimi projekti, EIP projekti in drugimi projekti, ki so financirani iz sredstev EU in/ali proračuna RS ter nalogami javnih služb v kmetijstvu za usklajen in sistematičen razvoj. Odgovoren je tudi za izmenjavo in prenos znanja do svetovalcev, kmetov in drugih končnih uporabnikov znanja. Nudi tudi vsebinsko podporo pri pripravi programov javnih služb s področja rastlinske proizvodnje, živinoreje, čebelarstva, genskih virov in javne službe kmetijskega svetovanja, ukvarja pa se tudi z vzpostavitvijo sistema demonstracijskih in učnih kmetij.