Sektor usmerja razvoj in izvajanje nalog, ki se nanašajo na področje hibridnih groženj, ocenjevanja tveganj in ogrožanja nacionalne varnosti ter civilnih zmogljivosti in geprostorske podpore.

Opravlja usmerjevalne in organizacijske naloge tudi na področju zagotavljanja civilnih zmogljivosti v podporo Slovenski vojski in zavezniškim silam ter razvoja kartografskega sistema za potrebe obrambe RS, skladno s standardi Nata in potrebami Slovenske vojske ter Republike Slovenije.

V zvezi z navedenim pripravlja in usklajuje izdelavo zakonskih, podzakonskih in drugih predpisov ter sodeluje pri pripravi gradiv drugih državnih organov, organizacij in institucij, ki se nanašajo na njegovo področje dela. Sektor spremlja delo delovnih teles Nata in EU z delovnega področja sektorja, ter usklajuje aktivnosti za zagotovitev civilnih zmogljivosti in opravlja naloge medresorskega usklajevanja za učinkovito naslavljanje hibridnih groženj, vključno s koordinacijo aktivnosti vezanih na članstvo RS v Evropskem centru odličnosti za soočanje s hibridnimi grožnjami (Hybrid CoE).

Delo sektorja je organizirano v treh oddelkih in sicer v Oddelku za hibridne grožnje, Oddelku za civilne zmogljivosti ter Oddelku za geoprostorsko podporo in vesolje.

Sektor za sodobne varnostne izzive je notranjeorganizacijska enota Direktorata za obrambne zadeve.