V Sekretariatu izvajamo strokovno-organizacijske, svetovalne in usklajevalne naloge za ministrstvo. Skrbimo za načrtovanje in izvajanje kadrovske politike ministrstva, za prostorske, tehnične in organizacijske pogoje dela, načrtujemo finančna sredstva za delo ministrstva ter usklajujemo in vodimo postopke porabe finančnih sredstev.