Sektor za pripravo mnenj in soglasij izdaja smernice in mnenja v postopkih sprejemanja državnih in občinskih prostorskih aktov (DPN in OPN) ter v postopkih lokacijske preveritve. Vodi postopke in izdaja projektne pogoje in vodna soglasja oziroma mnenja za objekte državnega pomena ter za naprave IED. Sektor organizira in usmerja regionalne geografske izpostave Sektorje območij k povezanemu in poenotenemu načinu dela na področju izdaje smernic in mnenj v postopkih sprejemanja občinskih podrobnih prostorskih načrtov (OPPN), v postopkih lokacijskih preveritev, projektnih pogojev, vodnih soglasij in mnenj.