Superračunalnik Vega v boju zoper COVID-19
- Ministrstvo za izobraževanje, znanost in šport
- Direktorat za znanost in inovacije
V preizkusnem, pripravljalnem obdobju je superračunalnik Vega, uradno predan v uporabo 20. aprila (posnetek otvoritve) nudil računske zmogljivosti ambiciozni pobudi COVID Moonshot za pospešitev razvoja protivirusnega zdravila COVID. Pomoč je bila realizirana preko projekta porazdeljenega računalništva Folding@Home, kjer se računske kapacitete uporabljajo za simulacijo dinamike beljakovin, vključno s postopkom zlaganja beljakovin in gibanjem beljakovin, vpletenih v različne bolezni. Na spletni strani Folding@Home so vse od 12. marca letos zapisali:
»Računalniško moč Folding@Home osredotočamo na SARS-CoV-2, virus, ki povzroča COVID-19, in človeške beljakovine, s katerimi virus sodeluje. Najprej smo odkrili nove proteinske strukture, ki prej niso bile dostopne raziskovalni skupnosti. Z vašo pomočjo zdaj v okviru sodelovanja COVID Moonshot preverjamo potencialna zdravila, ki ciljajo na te strukture. Skupaj smo ustvarili najmočnejši superračunalnik na planetu in z njim pomagamo razumeti SARS-CoV-2/COVID-19 in razviti nove terapije. Potrebujemo vašo pomoč in si prizadevamo za močno, patentirano zdravilo.«
Sistemi konzorcija SLING so že nekaj let vključeni v prizadevanja projekta Folding@Home. S krajšo izvedbo stresnega testa računske particije z grafičnimi pospeševalniki na sistemu HPC Vega je ta pripomogel k povečanju vzajemne računske moči. Prispevek HPC Vega v maju 2021 je razviden, saj je bilo zasedeno 5. mesto na lestvici donatorjev (dvig za 198 mest).
Stresni test osnovne računske particije HPC Vega pa je razveselil tudi znanstvenike iz mednarodnega laboratorija CERN, ustanovljenega leta 1954. V laboratoriju že vrsto let izvajajo projekt ATLAS, ki predstavlja enega od štirih glavnih poskusov na Velikem hadronskem trkalniku (LHC) v CERN-u. Gre za mednarodno sodelovanje pri eksperimentu fizike delcev za splošno uporabo. Za znanstvene izračune v projektu ATLAS se uporabljajo superračunalniki po celem svetu. V interni predstavitvi trenutnega stanja izvedenih računskih nalog sta znanstvenika Dr. Zachary Marshall (Lawrence Berkeley National Laboratory) in Dr. Alessandro Di Girolamo (CERN) prikazala tole sliko:
Superračunalnik Vega na Institutu informacijskih znanosti je delno sofinancirala Evropska unija iz Evropskega sklada za regionalni razvoj ter Ministrstvo za izobraževanje, znanost in šport v okviru Operativnega programa za izvajanje evropske kohezijske politike 2014-2020, obenem pa je prvi superračunalnik, ki ga je sofinanciralo skupno podjetje EuroHPC. Z njim Slovenija pridobiva na mednarodni veljavi na tem področju.