Center bo deloval v Mreži nacionalnih koordinacijskih centrov, ki deluje v okviru Evropskega industrijskega, tehnološkega in raziskovalnega kompetenčnega centra za kibernetsko varnost na podlagi Uredbe (EU) 2021/887 Evropskega parlamenta in Sveta z dne 20. maja 2021 o vzpostavitvi Evropskega industrijskega, tehnološkega in raziskovalnega kompetenčnega centra za kibernetsko varnost ter Mreže nacionalnih koordinacijskih centrov. 

Vlada Republike Slovenije je pooblastila Urad Vlade Republike Slovenije za informacijsko varnost, da se priglasi kot organ, ki bo deloval kot nacionalni koordinacijski center za kibernetsko varnost v namene zgoraj omenjene uredbe.