Omenjeni Protokol je bil podpisan za namen zagotavljanja spoštovanja pravil Skupne ribiške politike Evropske unije. Obe organizaciji sta izrazili pripravljenost za krepitev sodelovanja in usklajevanja ter za izvajanje skupnih programov nadzora, pregledov in nadzora ribiških dejavnosti.

Namen Protokola o medsebojnem sodelovanju je izvajanje učinkovitega nadzora ribiških dejavnosti in trženja ulova v okviru skupnostnega režima, ki ga urejajo uredbe Evropske unije. V okviru dejavnosti, predvidenih v navedenem Protokolu, so zajeti: deljenje podatkov iz lastnih sistemov za nadzor ribištva za lažje identifikacijo in nadzor ribiških plovil  pod suverenostjo obeh držav, skupni pregledi na ribiških plovilih, pregledi pri grosistih, ribarnicah in restavracijah, v distribucijskih centrih ter vzdolž celotne verige trženja ribiških proizvodov, izmenjava podatkov in informacij o trženju ribiških proizvodov, izkrcanju in pretovarjanju, o  ribolovnih dnevnikih ter o morebitnih dodatnih informativnih elementih, ki se štejejo za koristne in potrebne za zagotavljanje učinkovitosti nadzora, prav tako pa  usposabljanja.

Sprejet je bil tudi dogovor o organizaciji podobnega srečanja v Ljubljani z namenom razvijanja dodatnih oblik sodelovanja.