UVHVVR izdaja elektronska fitosanitarna spričevala za države, ki so sklenile dogovor z Evropsko komisijo glede sprejemanja elektronskih fitosanitarnih spričeval, izdanih v sistemu TRACES (angleško Trade Control and Expert System - TRACES). Države, ki trenutno sprejemajo elektronska spričevala so Argentina, ZDA, Čile, Peru, Panama, Kostarika, Mehika, Šrilanka, Združeno Kraljestvo, Izrael, Tunizija, Uzbekistan, Južna Koreja, Nova Zelandija in Norveška.

Zainteresirani izvozniki oziroma njihovi zastopniki vlogo za izdajo elektronskega fitosanitarnega spričevala za izvoz ali ponovni izvoz v države izven EU vložijo najmanj dva delovna dneva pred nakladanjem pošiljke na krajevno pristojni Območni urad UVHVVR oziroma na izstopno mesto (Kontrolno Središče Luka Koper ali Mejna kontrolna točka Brnik).

Vlagatelj podatke o pošiljki vnese na obrazec fitosanitarnega spričevala v sistemu TRACES in o tem po elektronski pošti obvesti pristojni organ.