Po prejemu pisne vloge za odpoved statusu socialnega podjetja z ustreznimi prilogami ministrstvo le-to prouči. Če je vloga popolna, pripravi odločbo, s katero nepridobitni pravni osebi odvzame status socialnega podjetja ter jo pošlje na sedež podjetja. Po pravnomočnosti odločbe, to je po 30 dneh po vročitvi, status socialnega podjetja preneha. 

Kljub odpovedi statusu socialnega podjetja lahko 24 mesecev po pravnomočnosti odločbe o odvzemu statusa socialnega podjetja nepridobitna pravna oseba, ki se je statusu odpovedala, ponovno odda vlogo za pridobitev statusa. Vlogo odda na registrski organ.